Το σύστημα αυτό υπόκειται σε συνεχείς ποιοτικούς ελέγχους από εκπροσώπους σημαιών και φορείς διαπίστευσης γιά την επάρκεια, την ακεραιότητά του και την συμμόρφωση του με τα αντίστοιχα θεσμικά πλαίσια, όπως είναι ο Διεθνής Κώδικας Αναγνωρισμένων Οργανισμών και τα πρότυπα ποιότητας κατά ISO 9001:2008 και ISO 17020:2012

Τα τελευταία χρόνια το σωματείο μας ελέγχεται από τον ΦΟΙΝΙΞ ΝΗΟΓΝΩΜΩΝ Α.Ε. γνωστό και σαν PHRS, τη διεθνώς αναγνωρισμένη Ελληνική Ανώνυμη Εταιρία με έδρα τον Πειραιά η οποία διεξάγει επιθεωρήσεις και έκδοση των προβλεπόμενων θεσμικών πιστοποιητικών για πλοία υπό Ελληνική σημαία με βάση την Εθνική νομοθεσία.